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Home Industry News Life Science Indica Labs kündigt KI-gestützte HALO®-Software für die digitale Pathologieforschung in den Biowissenschaften an
The 4.0 releases of HALO®, HALO AI, and HALO Link offer researchers and pathologists the latest advances in AI-powered tissue analysis

Indica Labs kündigt KI-gestützte HALO®-Software für die digitale Pathologieforschung in den Biowissenschaften an

11th June 2024

Indica Labs, der weltweit führende Anbieter von KI-gestützten digitalen Pathologielösungen, gab heute die Veröffentlichung der neuen Version seiner branchenführenden Life-Science-Software bekannt. Die Version 4.0 von HALO®, HALO AI und HALO Link bietet Forschern und Pathologen eine beispiellose Benutzerfreundlichkeit und Leistung sowie noch mehr Möglichkeiten, fortschrittliche KI-gestützte Bildanalysen in einem offenen Ökosystem für die digitale Pathologie zu nutzen.

Die zunehmende Verbreitung von künstlicher Intelligenz in der Pathologie ermöglicht neue Erkenntnisse und effizientere Arbeitsabläufe. Mit der Version 4.0 unterstützt Indica Labs die Anwender dabei, die Entdeckungen von morgen zu machen, indem es die Integration von KI-basierten Werkzeugen in die HALO-Plattform erweitert. Mit HALO 4.0 können Nutzer der KI-gestützten Bildanalyseplattform von Indica Labs vortrainierte Deep-Learning-basierte Netzwerke für eine präzise, automatisierte Kern- und Membransegmentierung sowohl im Hellfeld als auch in der Fluoreszenz nutzen. Diese fortschrittlichen Netzwerke sind sofort einsatzbereit und können über HALO AI angepasst werden.

Die neuen Algorithmen für die Bildregistrierung in HALO 4.0 basieren ebenfalls auf fortschrittlichem Deep Learning und ermöglichen eine schnelle und präzise Registrierung. Für Anwender, die in HALO AI 4.0 die nächste Generation von Deep-Learning-basierten Objekt- und Gewebeklassifikatoren trainieren, enthält das Train-by-Example-Toolset außerdem ein neues KI-gestütztes Annotationstool. Diese Funktion, die auf dem Segment Anything Model von Meta AI basiert und in der Lage ist, Objekte von der Größe eines Zellkerns bis hin zu einem Nierenquerschnitt zu annotieren, ermöglicht präzise Annotationen mit nur einem Klick, was die Erstellung von Trainingssets erheblich vereinfacht.

„Seit der Gründung von Indica vor 13 Jahren haben zahllose Anregungen von Anwendern und technische Entwicklungen dazu geführt, dass wir nun die Version 4.0 unserer Produkte für die Biowissenschaften herausgebracht haben“, sagt Dr. Anne Hellebust, Director of Product for Life Sciences. „Wir sind stolz darauf, unsere Führungsrolle in der digitalen Pathologie fortzusetzen, und wir freuen uns darauf, zu sehen, wie die Anwender das fortschrittliche, KI-gestützte Toolset der neuesten Version nutzen werden.“

Um den Anwendern zu helfen, die Herausforderungen der modernen Gewebeanalyse zu meistern, baut die Version 4.0 auf dem Erbe der leistungsstarken, intuitiven Software von Indica Labs auf und setzt neue Maßstäbe bei der Betrachtung von Objektträgern und der Optimierung von Arbeitsabläufen. Das Herzstück von HALO 4.0 ist ein neuer GPU-beschleunigter Viewer, der ein nahtloses Erlebnis für alle unterstützten Dateitypen bietet, mit reibungslosem Schwenken und Zoomen von stark gemultiplexten und umfangreich annotierten Bildern. Nutzer von HALO Link 4.0, der Plattform von Indica Labs für die kollaborative Pathologie, werden dank eines aktualisierten Bildservers ebenfalls eine erhebliche Leistungssteigerung und mehr Zeit für die Überprüfung und Analyse erfahren. Der neue Server ermöglicht auch die Anzeige von interaktiven HALO-Markups für eine reichhaltigere Datenvisualisierung, und diese Markups sind nun in noch mehr Modulen in 4.0 verfügbar, einschließlich der Module für In-situ-Hybridisierung und RNAscope™.

Die Arbeitsabläufe wurden in allen 4.0-Versionen optimiert, wobei HALO anpassbare Analyseausgaben bietet, so dass die Benutzer die Ergebnisse entsprechend der Anwendung einschränken und sogar Berechnungen unter Verwendung vorhandener Ausgaben erstellen können. Darüber hinaus wurde die Integration zwischen HALO und HALO Link weiter vertieft, da die Metadaten von HALO Link in HALO 4.0 angezeigt, sortiert und gefiltert werden können, um die Arbeitsabläufe zu unterstützen und die Datenanalyse zu bereichern. Schließlich wurden im gesamten Klassifikator-Workflow neue Features und Funktionalitäten eingeführt, darunter eine neue Klassifikator-Pipeline, eine Warteschlange für Trainingsjobs und eine farbenblindheitsfreundliche Standardpalette.

Mit der Version 4.0 führt Indica Labs sein erstes Add-on für HALO Link ein, das den Anwendern leistungsstarke Funktionen zur Verfügung stellt, die bestehende Prozesse ergänzen und die Gute Laborpraxis in der Forschungspathologie unterstützen. Das Compliance Add-on bietet Audits auf Systemebene, die alle datenerzeugenden oder -verändernden Aktivitäten erfassen. Diese können dann nach Benutzern, Aktionen oder nach Datum sortiert und gefiltert und als Tabellenkalkulation exportiert werden. Das Add-on enthält auch einen Workflow für Änderungsgründe, der separat von der Audit-Funktion konfiguriert werden kann und die Änderungsgründe der Benutzer erfasst und im Audit-Protokoll aufzeichnet.

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