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Tangerine Medical adopte le format de données MPEG-G pour le traitement de données génomique de bout en bout

4th December 2019

LAUSANNE, le 3 décembre 2019 â GenomSys, société de logiciels qui développe une technologie permettant un traitement et un partage efficaces des données de l'ADN, annonce une collaboration avec SysMeta IT, une société de services numériques s'occupant de cliniques et de laboratoires en Suisse et rédactrice en chef de Tangerine Medical et de Tangerine. Progiciels de diagnostic. GenomSys combine une expertise approfondie en compression de données et en informatique avec des capacités en sciences de la vie et en bioinformatique. Il fournit des technologies permettant de stocker et de transférer en toute sécurité des données génomiques, permettant ainsi aux instituts de recherche et aux cliniques d’obtenir une efficacité accrue dans le traitement des données génomiques. GenomSys est également l'un des premiers à adopter la norme ISO / IEC 23092 pour la représentation et le traitement de données génomiques – MPEG-G. SysMeta IT fournit aux cliniques médicales son logiciel de gestion des patients et ses outils de gestion de données de laboratoire depuis plus de 15 ans. Tangerine Medical est une application de gestion des patients adressée aux médecins qui permet aux médecins et aux spécialistes de visualiser et d’annoter les dossiers des patients et de soumettre des demandes d’analyses d’échantillons par voie électronique grâce à son intégration API avec les laboratoires. Démontrant l’efficacité de ses bibliothèques de logiciels et de ses technologies de stockage dans le cloud, GenomSys annonce aujourd’hui l’intégration de ses outils MPEG-G dans Tangerine Medical. "L'ajout de capacités de visualisation du génome et d'annotation des enregistrements médicaux profitera aux processeurs médicaux en leur offrant une vue entièrement intégrée du dossier du patient, y compris un accès instantané aux données génomiques stockées et aux résultats d'analyse correspondants", commente Laurent Missimi, PDG de SysMeta IT. Dans un cas pratique relatif à la pharmacogénomique qui sera présenté cette semaine au Congrès mondial BioData à Bâle, en Suisse, GenomSys montrera l’intégration du visualiseur de génome intégré (IGV) * prenant en charge un flux de données amélioré MPEG-G intégré au clinicien de Tangerine Medical UI. Il permet de visualiser instantanément le gène UGT1A1 qui est responsable de la glucuronidation de multiples xénobiotiques, notamment d’un métabolite actif de l’irinotécan. L'irinotécan est un médicament utilisé pour traiter le cancer du côlon et l'UGT1A1 prédit la toxicité et l'efficacité du traitement chez les patients traités par l'Irinotécan. L'intégration des outils GenomSys dans Tangerine Medical améliore la capacité du praticien d'évaluer et de classer les options de traitement pour les patients cancéreux. "L'exploitation des données de séquençage génétique et des analyses avancées permettra aux professionnels de la santé de gagner du temps et d'offrir de meilleures options de traitement aux patients. L'intégration des capacités de visualisation du génome dans les outils logiciels médicaux utilisés par les médecins a été entravée par l'absence de traitement efficace et rationalisé des données. Des technologies adaptées aux données génomiques et à l’utilisation clinique: Avec la récente introduction de la norme ISO 23092, de nouveaux outils de traitement de données génomiques de bout en bout vont voir le jour, avec une facilité d’utilisation plug & play. GenomSys est fier d’être à l’avant-garde de cette évolution vers une médecine personnalisée, rendue possible par l’interopérabilité et le traitement de données de pointe ", déclare Stéphane Doutriaux, PDG de GenomSys. "Nous nous dirigeons vers un système de santé plus durable où les applications médicales peuvent mieux guider les praticiens dans leur prise de décision, permettant ainsi le déploiement de thérapies ciblées", a déclaré Laurent Missimi. "Notre collaboration avec GenomSys nous permet d’être un leader dans la fourniture de services évolués et différenciés à nos clients des laboratoires et des cliniques". Claudio Alberti, co-fondateur et directeur technique de GenomSys, ajoute: "Nous travaillons depuis 4 ans en collaboration avec de nombreux professionnels du secteur pour élaborer des lignes directrices relatives à un format de données adapté à un traitement plus efficace de la génomique. Les principaux défis à relever sont liés à la De grandes quantités de données générées par NGS et le manque d'interopérabilité de bout en bout des formats existants tels que FASTQ, BAM, VCF: le secteur a atteint son objectif et, grâce à un processus ISO rigoureux, nous sommes maintenant en mesure de déployer la technologie conforme à ISO. applications et services ". Les parties intéressées peuvent rencontrer l'équipe de GenomSys sur leur stand lors du congrès BioData World à Bâle, les 4 et 5 décembre 2019, ou en contactant un représentant. * L'IGV est un produit du Broad Institute. Pour plus d'informations, voir James T. Robinson, Helga Thorvaldsdóttir, Aaron M. Wenger, Ahmet Zehir et Jill P. Mesirov. Examen des variantes avec le visualiseur de génomique intégrative (IGV). Cancer Research 77 (21) 31-34 (2017). À propos de GenomSys GenomSys est une société suisse qui développe des outils et des applications d’entreprise pour le stockage, le traitement et le partage sécurisés de données d’ADN permettant la génomique à grande échelle et des applications de médecine personnalisée. La société allie une profonde expertise en compression de données et en informatique à des capacités en sciences de la vie et en bioinformatique. Adoptant la norme récemment publiée ISO / IEC 23092 pour la représentation et le traitement des données génomiques (également appelée MPEG-G), GenomSys fournit des technologies de compression, de stockage et de transmission en continu des données génomiques permettant aux instituts de recherche et aux cliniques de gagner en efficacité traitement des données génomiques. Plus d'informations: www.genomsys.com Twitter: suivez @GenomSys Linkedin: https: //www.linkedin.com/company/18320811 Contact: Raphael Bernard, responsable marketing et communications: raphael.bernard@genomsys.com Tel: +41 78 784 06 76 À propos de SysMeta IT SysMeta IT, dont le siège est à Lausanne, en Suisse, fournit aux cliniques médicales son logiciel de gestion des patients et ses outils de gestion des données de laboratoire depuis plus de 15 ans. Tangerine Medical est une application de gestion des patients adressée aux médecins qui permet aux médecins et aux spécialistes de visualiser et d’annoter les dossiers des patients et de soumettre des demandes d’analyses d’échantillons par voie électronique grâce à son intégration API avec les laboratoires. Les autres produits incluent Tangerine Diagnostics. www.sysmeta.ch

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