Loop Genomics lance quatre nouveaux kits de microbiome

Loop Genomics, société de séquençage à molécule longue et à molécule unique dotée d'une solution sans matériel, a étendu ses fonctionnalités de kits et de services afin de fournir aux chercheurs de nouvelles solutions de séquençage de microbiome à ultra haute résolution utilisant des lectures longues sur des séquenceurs Illumina. Les quatre nouveaux kits sont un kit complet 16S pleine longueur V1-V9 à faible biomasse (p. Ex. Peau humaine) avec des quantités d'entrée de picogramme et zéro arrière-plan d'ADN humain, une solution à longue lecture 18S-ITS1-ITS2 en phase pour le mycobiome fongique à ultra haute résolution profilage qui interroge une région contiguë du génome d’environ 2,5 Ko (ce kit contient également une version à faible biomasse) et un kit de lecture en nuage 16S offrant une solution à moindre coût pour les laboratoires cherchant une quantification du microbiome basée sur UMI avec une couverture V1-V9, mais sans mise en phase V1-V9. En utilisant des instruments de séquençage Illumina associés aux kits de préparation d'échantillons Loop Genomics, les chercheurs réduisent les coûts et en tirent des enseignements significatifs grâce à un kit plug and play utilisant des consommables de séquençage de base peu coûteux par rapport à d'autres plates-formes à lecture longue. Un laboratoire doit simplement remplacer leurs kits de préparation d’échantillons pour leurs expériences Microbiome par des kits de préparation d’échantillons Loop. Loop Genomics fournit ces kits de microbiome abordables (29 à 40 USD par échantillon) et ces services (149 à 199 USD par échantillon) pour identifier la présence et l'abondance relative des organismes présents dans les microbiomes testés par la trousse en vue de leur utilisation par UMI. Séquenceur Illumina. En outre, le pipeline de calcul de Loop, inclus dans le coût du kit, non seulement reconstitue une recréation informatique intensive des lectures longues à partir de nuages de lectures courtes, mais fournit également des rapports exploitables afin que les chercheurs puissent déterminer rapidement la prochaine expérience qu’ils souhaitent réaliser. . Selon Tuval Ben Yehezkel, PhD, PDG et fondateur de Loop Genomics, "avec les premiers utilisateurs des nouveaux kits et services, notamment l’Hôpital de l’Arkansas, SARDI, UC Davis et l’USDA, ces nouveaux produits répondent à des besoins immédiats et génèrent des données très intéressantes. Nous sommes fiers de continuer à tirer parti de notre technologie de base pour commercialiser trois nouveaux kits, le premier du genre dans l’espace Microbiome, et nous continuerons à traduire les dernières avancées en matière de séquençage synthétique à lecture longue en produits destinés aux chercheurs qui souhaitent obtenir de meilleures données génomiques ". Notes aux rédacteurs: Fondée à la fin de 2015, Loop Genomics est une société de la région de la baie de San Francisco qui propose une nouvelle technologie de séquençage synthétique à lecture longue sans matériel. Outre ses offres de transcriptome, la société propose divers kits et services pour le séquençage de microbiomes à lecture longue et l’assemblage de génomes microbiens à lecture longue.