Samplix CRISPR Validation Services – Validation approfondie des échantillons conçus par CRISPR par les experts

Samplix a lancé un nouveau service pour injecter de la transparence dans la technologie de pointe d'édition de gènes d'aujourd'hui, CRISPR. L'équipe de service reçoit, manipule et gère des échantillons de génomes modifiés. Grâce à la capture de séquence indirecte Xdrop ™, ils enrichissent de longs fragments d'ADN qui contiennent une séquence de détection soigneusement conçue placée à 5-10 kb du site édité par CRISPR. Ils séquencent ensuite l'ADN enrichi sous forme de lectures longues sur le séquenceur Oxford Nanopore et de lectures courtes sur une plate-forme Illumina pour reconstruire en détail les réarrangements structurels, SNP ou autres modifications involontaires. Xdrop ™ est la technologie exclusive de Samplix ™ pour enrichir les régions génomiques de plus de 100 kb à partir d'aussi peu que 1 ng d'ADN génomique et avec une résolution à une seule molécule. Contrairement aux autres méthodes d'enrichissement de cible, Xdrop ™ ne nécessite la connaissance que d'une courte séquence à l'intérieur ou en bordure de la région cible pour une sélection de cible efficace. Suite à une sélection ciblée, une amplification par déplacement multiple est appliquée à des molécules d'ADN uniques compartimentées en gouttelettes. Cela garantit une amplification non biaisée de grands fragments d'ADN qui sont représentatifs de la variation cible dans l'échantillon d'origine. «Notre équipe de R&D a pu démontrer que Xdrop ™ peut caractériser les suppressions et réarrangements involontaires survenant lors de l'édition CRISPR qui ne sont pas détectés avec les méthodes de validation couramment utilisées. Nous avons estimé qu'il était important d'aider les chercheurs à éviter les pièges méthodologiques qui pourraient cacher le résultat plus large de leur édition. Nos nouveaux services apportent cette transparence à n'importe quel laboratoire », explique Henrik Pfundheller, vice-président des opérations commerciales. La même équipe d'experts de scientifiques et de techniciens de laboratoire avec plus de 10 ans d'expérience dans les services internationaux de génomique, la gestion de types d'échantillons précieux, la logistique des projets et le service client dédié gère également les projets basés sur CRISPR. En collaboration avec Samplix R&D, ils ont établi des protocoles et des procédures d'exploitation robustes pour garantir des résultats de la plus haute qualité et des informations sans équivoque. «L'équipe de service est dans une position unique», poursuit Pfundheller. «Ils collaborent avec nos clients, en échangeant régulièrement des idées sur comment et où Xdrop ™ peut être implémenté. Ils connaissent la technologie; ils connaissent les besoins. Et avec son application dans la validation des résultats CRISPR, ils apportent une valeur inestimable aux chercheurs du monde entier.