PacBio lance une solution de transcriptome unicellulaire inaugurant une nouvelle ère de découverte d'ARN

PacBio (NASDAQ : PACB), l'un des principaux développeurs de solutions de séquençage de haute qualité et très précises, a annoncé aujourd'hui le lancement de son kit de séquençage de matrices multiplexées (MAS-Seq) en partenariat avec le Broad Institute du MIT et de Harvard et 10x Genomics, Inc. Le kit est une solution en kit unique en son genre tirant parti de la technologie 10x Genomics® Single Cell Gene Expression pour permettre un séquençage rentable de l'ARN unicellulaire à lecture longue pour une interrogation plus complète du transcriptome. Les connaissances générées par les expériences de séquençage d'ARN unicellulaire peuvent alimenter la découverte de nouvelles maladies et l'identification de cibles thérapeutiques dans de nombreuses catégories. « Nous sommes ravis de collaborer avec ces organisations innovantes et d'apporter de nouvelles capacités à nos clients, leur permettant de débloquer de nouvelles découvertes dans leurs recherches », a déclaré Christian Henry, président et chef de la direction de PacBio. « Avec ce kit unique en son genre, PacBio vise à habiliter la recherche unicellulaire des clients d'une manière qui n'a pas été possible auparavant. La disponibilité de MAS-Seq est une étape importante pour PacBio. MAS-Seq aidera les chercheurs unicellulaires à mieux identifier et caractériser de nouvelles isoformes, de nouvelles mutations conductrices et des gènes de fusion du cancer, qui sont particulièrement pertinents dans les domaines de la recherche sur le cancer et des maladies neurodégénératives. « Comprendre l'hétérogénéité cellulaire au niveau des isoformes est essentiel pour la recherche fondamentale et la recherche sur les maladies », a déclaré Jeff Eidel, directeur commercial de PacBio. "Nos clients comprennent la nécessité du séquençage HiFi pour obtenir avec précision des isoformes pleine longueur à une résolution unicellulaire. Avec la technologie MAS-Seq, nous visons à augmenter le débit qui permet aux clients d'utiliser HiFi pour le séquençage d'ARN unicellulaire dans d'une manière rentable." Avec le kit, PacBio publiera également un nouveau logiciel SMRTLink qui prend en charge l'analyse du transcriptome unicellulaire, aidant les chercheurs à glaner facilement des informations à partir de leurs données. "La révolution de la cellule unique a déjà conduit à des découvertes révolutionnaires dans la recherche biomédicale et a transformé notre compréhension de la maladie et du développement, mais il y a tellement d'autres questions de recherche et applications qui attendent de bénéficier de la puissance de l'analyse de cellule unique", a déclaré Edwin Hauw, Vice-président du marketing pour 10x Genomics. « Nous pensons que la capacité à caractériser des cellules individuelles au niveau des isoformes de transcription alimentera les découvertes de nouveaux biomarqueurs qui sont importants à la fois pour la recherche sur les maladies et la fonction cellulaire, aidant à débloquer de nouvelles connaissances biologiques et à ouvrir de nouveaux domaines d'application. La combinaison du MAS -Le kit Seq avec nos tests de chrome à la pointe de l'industrie est encore une autre façon dont 10x Genomics travaille pour construire et fournir le portefeuille de cellules uniques le plus complet pour les chercheurs du monde entier. » Le kit MAS-Seq est le premier d'une série de produits de PacBio à être inclus dans son partenariat avec 10x Genomics dans le cadre de leur programme de partenariat compatible (CPP). Le programme partenaire compatible comprend des produits qui ont été vérifiés avec les flux de travail 10x Genomics. "À ce jour, nous avons eu un énorme succès en utilisant l'Iso-Seq en masse pour faciliter la découverte de nouveaux événements régulateurs résolus par des gènes et des isoformes concernant des maladies et des états de développement spécifiques. Aujourd'hui, nous sommes ravis d'appliquer la technologie MAS-Seq pour être pionnier au-delà des tissus -associations spécifiques et commencer à attribuer ces caractéristiques transcriptionnelles à des populations cellulaires spécifiques. Les données MAS-Seq permettront finalement de mieux stratifier la biologie associée à la maladie et permettront une découverte plus robuste de biomarqueurs pour une validation fonctionnelle future de l'organisme au tissu et maintenant des résultats spécifiques à la cellule ", a déclaré Robert P. Sebra, Ph.D., professeur de génétique et de sciences génomiques et directeur du Center for Advanced Genomics Technology à la Icahn School of Medicine de Mount Sinai. PacBio accepte maintenant les commandes du kit MAS-Seq qui commencera à être expédié début novembre. PacBio organisera un webinaire le 16 novembre 2022 qui décrit en détail la bibliothèque MAS-Seq et le flux de travail bioinformatique et est ouvert aux inscriptions ici.