Loop Genomics bringt vier neue Microbiome-Kits auf den Markt

Loop Genomics, das Einzelmolekül-Long-Read-Sequenzierungsunternehmen mit einer hardwarefreien Lösung, hat seine Kit- und Service-Funktionen erweitert, um Forschern neue ultrahochauflösende Microbiome-Sequenzierungslösungen mit Long-Read-Funktion für Illumina-Sequenzierer zur Verfügung zu stellen. Bei den vier neuen Kits handelt es sich um ein V1-V9-Kit mit niedriger Biomassephase (z. B. für die menschliche Haut) und 16S-Länge mit Pikogrammeingabemengen und null Human-DNA-Hintergrund, eine phasengesteuerte 18S-ITS1-ITS2-Lösung für hochauflösendes Pilz-Mykobiom Profiling, das eine ~ 2,5 KB große zusammenhängende Region des Genoms abfragt (dieses Kit hat auch eine Version mit geringer Biomasse) und ein 16S-Read-Cloud-Kit, das eine kostengünstigere Lösung für Labors bietet, die eine UMI-basierte Quantifizierung von Mikrobiomen mit V1-V9-Abdeckung suchen, aber ohne V1-V9-Phaseneinstellung. Durch die Verwendung von Illumina-Sequenzierungsinstrumenten in Verbindung mit Loop Genomics-Probenvorbereitungskits senken die Forscher die Kosten und gewinnen wichtige Erkenntnisse mit einem Plug-and-Play-Kit, das im Vergleich zu anderen Plattformen mit langer Lesedauer kostengünstige Kernsequenzierungs-Verbrauchsmaterialien verwendet. Ein Labor muss lediglich die Probenvorbereitungskits für die Microbiome-Experimente durch Loop-Probenvorbereitungskits ersetzen. Loop Genomics bietet diese erschwinglichen Microbiome-Kits (29 bis 40 USD / Probe) und Services (149 bis 199 USD / Probe) an, um das Vorhandensein und die relative Häufigkeit von Organismen in den Microbiomes zu identifizieren, die die Kits auf die Verwendung von UMIs testen Illumina Sequenzer. Darüber hinaus ermöglicht die in den Kosten des Kits enthaltene Berechnungs-Pipeline von Loop nicht nur die rechenintensive Neuerstellung der langen Lesevorgänge aus Wolken kurzer Lesevorgänge, sondern liefert auch umsetzbare Berichte, damit die Forscher schnell herausfinden können, welches Experiment sie durchführen möchten . Laut Tuval Ben Yehezkel PhD, CEO und Gründer von Loop Genomics, "lösen SARDI, UC Davis und das USDA mit den frühen Anwendern der neuen Kits und Services, einschließlich des Arkansas Childrenâs Hospital, die unmittelbaren Bedürfnisse und generieren einige sehr interessante Daten. Wir sind stolz darauf, unsere Kerntechnologie weiter nutzen zu können, um drei neue Kits auf den Markt zu bringen, die ersten ihrer Art im Bereich Mikrobiom. Wir werden auch weiterhin die neuesten Fortschritte bei der synthetischen Langzeit-Lesesequenzierung in Produkte für Forscher umsetzen, die sich um Folgendes bemühen: bessere Genomdaten bekommen. " Hinweis für Redakteure: Loop Genomics wurde Ende 2015 gegründet und ist ein Unternehmen in der Bucht von San Francisco, das eine neuartige Technologie für die hardwarefreie synthetische Sequenzierung mit langer Lesedauer anbietet. Zusätzlich zu seinem Transkriptom-Angebot bietet das Unternehmen verschiedene Kits und Services für die Sequenzierung von langgelesenen Mikrobiomen und die Zusammenstellung von langgelesenen mikrobiellen Genomen an.