CES wurde entwickelt, um die Krebspräzisionsmedizin zu unterstützen

Forscher des FIMM an der Universität Helsinki haben eine neuartige Computermethode namens Combined Essentiality Scoring (CES) entwickelt, mit der sich wichtige Gene in Krebszellen präzise identifizieren lassen, um genetische Screening-Daten zu harmonisieren. Das kombinierte essentielle Scoring verwendet Daten aus molekularen Merkmalen von Krebszellen und Daten aus CRISPR-Cas9- und shRNA-Screens, um krebsessentielle Gene vorherzusagen. Während ihrer Forschung konnten die Wissenschaftler nachweisen, dass CES in der Lage ist, essentielle Gene genauer zu identifizieren als derzeitige rechnerische Mittel. Tatsächlich wurden zwei vorhergesagte krebsessentielle Gene unabhängig voneinander mit einer Diagnose für Leukämie- und Brustkrebspatientinnen in Verbindung gebracht, was positiv ist Zeichen für die Entwicklung von Krebsmedikamenten. Der Erstautor der Studie, Wenyu Wang, erklärte: "shRNA und CRISPR-Cas9 sind die beiden gebräuchlichen Techniken für das genetische Screening mit hohem Durchsatz. Trotz verbesserter Qualitätskontrolle unterscheiden sich die Gen-Essentialitäts-Scores dieser beiden Techniken auf der gleiche Krebszelllinien. " Assistenzprofessor Jing Tang, korrespondierender Autor der Studie, erklärte: "Die Verbesserung der Gen-Essentialitätsbewertung ist nur ein Anfang. Unser nächstes Ziel ist die Vorhersage von Wechselwirkungen zwischen Wirkstoffen durch Integration von Sensitivitäts- und Gen-Essentialitätsprofilen. Angesichts der ständig wachsenden Menge an funktionellen Screening-Datensätzen Wir hoffen, unser Wissen über Wirkstoffzielprofile erweitern zu können, die letztendlich der Wirkstoffentdeckung in der personalisierten Medizin zugute kommen. “