Tangerine Medical verwendet das MPEG-G-Datenformat für die durchgängige Verarbeitung genomischer Daten

LAUSANNE, 3. Dezember 2019 – GenomSys, ein Softwareunternehmen, das Technologien für die effiziente Verarbeitung und Weitergabe von DNA-Daten entwickelt, gibt eine Zusammenarbeit mit SysMeta IT bekannt, einem digitalen Dienstleistungsunternehmen für medizinische Kliniken und Labors in der Schweiz und Herausgeber von Tangerine Medical und Tangerine Diagnose-Softwarepakete. GenomSys kombiniert fundiertes Know-how in den Bereichen Datenkomprimierung und Computing mit Life Sciences und Bioinformatik. Es bietet Technologien für die sichere Speicherung und Übertragung von Genomdaten, mit denen Forschungseinrichtungen und Kliniken die Verarbeitung von Genomdaten effizienter gestalten können. GenomSys ist auch ein früher Anwender des ISO / IEC 23092-Standards für die Darstellung und Verarbeitung von Genomdaten – MPEG-G. SysMeta IT liefert seit über 15 Jahren seine Patientenverwaltungssoftware und seine Labordatenverwaltungstools an Kliniken. Tangerine Medical ist eine Patientenverwaltungsanwendung für Ärzte, die es Ärzten und Fachleuten ermöglicht, Patientenakten anzuzeigen und zu kommentieren und Probenanalysenanforderungen über die API-Integration mit Labors elektronisch zu übermitteln. GenomSys demonstriert die Effektivität seiner Softwarebibliotheken und Cloud-Speichertechnologien und gibt heute die Integration seiner MPEG-G-basierten Tools in Tangerine Medical bekannt. "Durch die Erweiterung der Funktionen für die Anzeige von Genomen und die Annotation von Krankenakten profitieren medizinische Fachkräfte von einer vollständig integrierten Ansicht der Patientenakte, einschließlich des sofortigen Zugriffs auf gespeicherte Genomdaten und zugehörige Analyseergebnisse", kommentiert Laurent Missimi, CEO von SysMeta IT. In einem praktischen Fall zur Pharmakogenomik, der diese Woche auf dem BioData World Congress in Basel, Schweiz, vorgestellt wird, zeigt GenomSys die Integration des Integrativen Genom-Viewers (IGV) *, der einen MPEG-G-erweiterten Datenstrom unterstützt, der in den Klinikarzt von Tangerine Medical eingebettet ist Benutzeroberfläche Es ermöglicht die sofortige Anzeige des UGT1A1-Gens, das für die Glucuronidierung mehrerer Xenobiotika, einschließlich eines aktiven Irinotecan-Metaboliten, verantwortlich ist. Irinotecan ist ein Medikament zur Behandlung von Dickdarmkrebs. UGT1A1 sagt die Toxizität und Wirksamkeit der Behandlung bei mit Irinotecan behandelten Patienten voraus. Die Integration von GenomSys-Tools in Tangerine Medical verbessert die Fähigkeit des Arztes, Behandlungsoptionen für Krebspatienten zu bewerten und zu bewerten. "Durch die Nutzung genetischer Sequenzierungsdaten und fortschrittlicher Analysen können Mediziner Zeit sparen und Patienten bessere Behandlungsmöglichkeiten bieten. Die Integration von Funktionen zur Genomanzeige in die von Ärzten verwendeten medizinischen Softwaretools wurde durch das Fehlen einer effizienten, rationalisierten Datenverarbeitung erschwert An genomische Daten und den klinischen Gebrauch angepasste Technologien Mit der Einführung von ISO 23092 werden neue End-to-End-Tools für die Verarbeitung genomischer Daten auf den Markt gebracht, die Plug-and-Play-fähig sind Auf dem Weg zu einer personalisierten Medizin, die durch Interoperabilität und fortschrittliche Datenverarbeitung ermöglicht wird ", sagt Stéphane Doutriaux, CEO von GenomSys. "Wir bewegen uns in Richtung eines nachhaltigeren Gesundheitssystems, in dem medizinische Apps die Anwender bei ihren Entscheidungen besser leiten und den Einsatz zielgerichteter Therapeutika ermöglichen können", sagt Laurent Missimi. "Unsere Zusammenarbeit mit GenomSys ermöglicht es uns, führend bei der Bereitstellung fortschrittlicher, differenzierter Dienstleistungen für unsere Labor- und Klinikkunden zu sein." Claudio Alberti, Mitbegründer und CTO von GenomSys, fügt hinzu: "Wir arbeiten seit 4 Jahren in Zusammenarbeit mit vielen Branchenfachleuten an Richtlinien für ein Datenformat, das an eine effizientere Verarbeitung genomischer Daten angepasst ist. Die wichtigsten Herausforderungen, die es zu bewältigen gilt, waren verbunden mit dem Unzählige Datenmengen, die durch NGS generiert wurden, und die fehlende End-to-End-Interoperabilität vorhandener Formate wie FASTQ, BAM und VCF Die Branche hat ihr Ziel erreicht und dank eines strengen ISO-Prozesses können wir jetzt ISO-konforme Formate implementieren Apps und Dienste ". Interessenten können das GenomSys-Team an ihrem Stand auf dem BioData World Congress in Basel vom 4. bis 5. Dezember 2019 oder durch Kontaktaufnahme mit einem Vertreter treffen. * IGV ist ein Produkt des Broad Institute. Weitere Informationen erhalten Sie von James T. Robinson, Helga Thorvaldsdóttir, Aaron M. Wenger, Ahmet Zehir und Jill P. Mesirov. Variantenbewertung mit dem Integrative Genomics Viewer (IGV). Cancer Research 77 (21) 31-34 (2017). Über GenomSys GenomSys ist ein Schweizer Unternehmen, das Tools und Anwendungen für die sichere Speicherung, Verarbeitung und gemeinsame Nutzung von DNA-Daten entwickelt, die umfangreiche Genomik- und personalisierte Medizinanwendungen ermöglichen. Das Unternehmen kombiniert fundiertes Know-how in den Bereichen Datenkomprimierung und Computing mit den Fähigkeiten der Biowissenschaften und Bioinformatik. GenomSys ist ein früher Anwender des kürzlich veröffentlichten Standards ISO / IEC 23092 für die Darstellung und Verarbeitung von Genomdaten (auch als MPEG-G bezeichnet) und bietet Komprimierungs-, Speicher- und Genomdaten-Streaming-Technologien, mit denen Forschungseinrichtungen und Kliniken Effizienzsteigerungen erzielen können Umgang mit genomischen Daten. Weitere Informationen: www.genomsys.com Twitter: follow @GenomSys Linkedin: https://www.linkedin.com/company/18320811 Kontakt: Raphael Bernard, Marketing- und Kommunikationsmanager: raphael.bernard@genomsys.com Tel: +41 78 784 06 76 Über SysMeta IT SysMeta IT mit Hauptsitz in Lausanne, Schweiz, liefert seit über 15 Jahren seine Patientenverwaltungssoftware und seine Labordatenverwaltungstools an Kliniken. Tangerine Medical ist eine Patientenverwaltungsanwendung für Ärzte, die es Ärzten und Fachleuten ermöglicht, Patientenakten anzuzeigen und zu kommentieren und Probenanalysenanforderungen über die API-Integration mit Labors elektronisch zu übermitteln. Weitere Produkte sind Tangerine Diagnostics. www.sysmeta.ch