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PacBio bringt Einzelzell-Transkriptomlösung auf den Markt, die eine neue Ära der RNA-Entdeckung einleitet
PacBio (NASDAQ: PACB), ein führender Entwickler hochwertiger, hochpräziser Sequenzierungslösungen, gab heute die Markteinführung seines Multiplexed Arrays Sequencing (MAS-Seq)-Kits in Partnerschaft mit dem Broad Institute of MIT and Harvard und 10x Genomics, Inc. bekannt Das Kit ist die erste Lösung ihrer Art, die die 10x Genomics Single Cell Gene Expression-Technologie nutzt, um eine kostengünstige Long-Read-Einzelzell-RNA-Sequenzierung für eine vollständigere Abfrage des Transkriptoms zu ermöglichen. Erkenntnisse aus Einzelzell-RNA-Sequenzierungsexperimenten können die Entdeckung neuer Krankheiten und die Identifizierung therapeutischer Ziele in vielen Kategorien vorantreiben. "Wir freuen uns sehr, mit diesen innovativen Organisationen zusammenzuarbeiten und unseren Kunden neue Möglichkeiten zu bieten, die es ihnen ermöglichen, neue Entdeckungen in ihrer Forschung zu erschließen", sagte Christian Henry, President und Chief Executive Officer von PacBio. "Mit diesem einzigartigen Kit möchte PacBio die Einzelzellforschung der Kunden auf eine Weise ermöglichen, die zuvor nicht möglich war. Die Verfügbarkeit von MAS-Seq ist ein bedeutender Meilenstein für PacBio." MAS-Seq wird Einzelzellforschern helfen, neuartige Isoformen, neuartige Treibermutationen und Krebsfusionsgene besser zu identifizieren und zu charakterisieren, die in den Bereichen Krebsforschung und neurodegenerative Erkrankungen besonders relevant sind. "Das Verständnis der Zellheterogenität auf Isoformenebene ist für die Grundlagen- und Krankheitsforschung von entscheidender Bedeutung", sagte Jeff Eidel, Chief Commercial Officer bei PacBio. „Unsere Kunden verstehen die Notwendigkeit der HiFi-Sequenzierung, um Isoformen in voller Länge mit Genauigkeit in Einzelzellauflösung zu erhalten. Mit der MAS-Seq-Technologie wollen wir die Durchsatzsteigerung erreichen, die es Kunden ermöglicht, HiFi für die Einzelzell-RNA-Sequenzierung zu verwenden auf kostengünstige Weise." Zusammen mit dem Kit wird PacBio auch die neue SMRTLink-Software veröffentlichen, die die Einzelzell-Transkriptomanalyse unterstützt und Forschern dabei hilft, auf einfache Weise Erkenntnisse aus ihren Daten zu gewinnen. „Die Einzelzellrevolution hat bereits zu bahnbrechenden Entdeckungen in der biomedizinischen Forschung geführt und unser Verständnis von Krankheit und Entwicklung verändert, aber es gibt noch so viele weitere Forschungsfragen und Anwendungen, die darauf warten, von der Leistungsfähigkeit der Einzelzellanalyse zu profitieren“, sagte Edwin Hauw, Vizepräsident für Marketing bei 10x Genomics. „Wir glauben, dass die Fähigkeit, einzelne Zellen auf Transkript-Isoform-Ebene zu charakterisieren, die Entdeckung neuer Biomarker vorantreiben wird, die sowohl für die Krankheitsforschung als auch für die Zellfunktion wichtig sind, und dazu beitragen, neue biologische Erkenntnisse zu gewinnen und neue Anwendungsbereiche zu erschließen.“ Die Kombination des MAS -Seq-Kit mit unseren branchenführenden Chromium-Assays ist ein weiterer Weg, mit dem 10x Genomics daran arbeitet, das umfassendste Einzelzell-Portfolio für Forscher weltweit aufzubauen und bereitzustellen." Das MAS-Seq-Kit ist das erste einer Reihe von Produkten von PacBio, das in die Partnerschaft mit 10x Genomics als Teil ihres kompatiblen Partnerprogramms (CPP) aufgenommen wird. Das kompatible Partnerprogramm umfasst Produkte, die mit 10x Genomics-Workflows verifiziert wurden. „Bisher haben wir mit Bulk-Iso-Seq enorme Erfolge erzielt, um die Entdeckung neuer gen- und isoformaufgelöster regulatorischer Ereignisse zu erleichtern, die sich auf bestimmte Krankheits- und Entwicklungsstadien beziehen. Heute freuen wir uns darauf, die MAS-Seq-Technologie anzuwenden, um über das Gewebe hinaus Pionierarbeit zu leisten -spezifische Assoziationen und beginnen damit, diese Transkriptionsmerkmale bestimmten Zellpopulationen zuzuordnen. MAS-Seq-Daten werden letztendlich die krankheitsassoziierte Biologie besser stratifizieren und eine robustere Entdeckung von Biomarkern für die zukünftige funktionelle Validierung vom Organismus zum Gewebe und jetzt zellspezifische Ergebnisse ermöglichen", sagte Robert P. Sebra, Ph.D., Professor für Genetik und Genomik und Direktor des Center for Advanced Genomics Technology an der Icahn School of Medicine am Mount Sinai. PacBio nimmt jetzt Bestellungen für das MAS-Seq-Kit an, das Anfang November ausgeliefert wird. PacBio wird am 16. November 2022 ein Webinar veranstalten, das die MAS-Seq-Bibliothek und den Bioinformatik-Workflow im Detail beschreibt und hier zur Anmeldung geöffnet ist.
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