L'espoir n'est pas perdu pour les 50 % de patients atteints de maladies rares sans réponses

« L'espoir n'est pas perdu pour les personnes atteintes de maladies rares non diagnostiquées » était le message clé de la présentation donnée par Neil Ward, vice-président et directeur général EMEA de PacBio, lors du Genomics England Research Summit. Environ 3,5 millions de personnes (1 sur 17) au Royaume-Uni souffrent ou sont affectées par une maladie rare, mais trouver les causes sous-jacentes d’une maladie rare constitue un défi de taille, les personnes attendant en moyenne 4 à 5 ans pour obtenir des réponses. En plus du coût personnel élevé, la recherche a révélé que le processus de diagnostic complexe a coûté au NHS England plus de 3,4 milliards de livres sterling au cours des dix dernières années. Alors que 80 % des maladies rares ont des origines génétiques, Ward a souligné que moins de 50 % des patients atteints de maladies rares ont reçu un diagnostic, même avec un séquençage du génome entier à lecture courte. Il a fait valoir que les techniques de test actuellement utilisées au Royaume-Uni sont obsolètes et que des technologies alternatives pourraient fournir davantage de réponses plus rapidement. « Le Royaume-Uni a investi de manière significative dans la recherche en génomique pour lutter contre les maladies rares. Des initiatives telles que le projet 100 000 génomes ont certainement contribué à des avancées significatives dans le domaine de la santé humaine. Mais nous devons maintenant nous concentrer sur l'obtention de réponses pour ceux qui sont encore dans le flou », commente Ward. « Des technologies génomiques plus avancées sont désormais disponibles et peuvent faire la lumière sur certaines des variantes les plus difficiles qui auraient pu être manquées lors de l'analyse initiale. Si le Royaume-Uni veut maintenir sa position de superpuissance scientifique – et apporter aux familles les réponses qu'elles méritent – nous devons investir dans les dernières méthodes de séquençage. » La voie standard actuelle pour les maladies rares varie à travers le Royaume-Uni ; En Angleterre et au Pays de Galles, le séquençage du génome entier en lecture courte constitue la norme de soins actuelle. Ce processus implique que l'ADN soit décomposé en petits fragments qui sont ensuite alignés sur un génome de référence dans l'espoir d'identifier des variantes potentiellement responsables de la maladie. Selon les données présentées par Ward lors du Sommet, ces tests échouent dans plus de 50 % des cas. Pendant ce temps, l'Écosse utilise une technique de « processus d'élimination » en plusieurs étapes appelée séquençage de l'exome, qui recherche de petits changements génétiques associés à des maladies rares spécifiques. Cependant, ces tests sont limités à seulement 50 millions de paires de bases, sur les 3 milliards que compte le génome humain, de sorte que le test ne peut pas détecter certaines des variations les plus longues et les plus complexes liées aux maladies rares. Ward a expliqué comment une technologie de séquençage alternative appelée séquençage HiFi à lecture longue pourrait jouer un rôle clé pour améliorer la compréhension des maladies rares pour les chercheurs du Royaume-Uni. Cette technologie utilise des séquences d’ADN beaucoup plus longues et, lorsqu’elle est combinée à de nouveaux outils informatiques d’analyse de données de pointe, elle fournit des informations plus approfondies et plus précises sur le génome que les tests génétiques conventionnels. Selon Ward, l’utilisation du séquençage à lecture longue plus tôt dans le processus pourrait à terme réduire les coûts et fournir de meilleures informations aux familles souhaitant comprendre le fondement génétique de certaines maladies rares. « Il y a de l'espoir pour ceux qui attendent encore des réponses. Le coût des lectures longues a considérablement diminué au cours de l'année écoulée, ce qui rend plus réalisable leur mise en œuvre à grande échelle », a poursuivi Ward. « Le NHS a été le premier service de santé au monde à proposer le séquençage du génome entier en lecture courte dans le cadre des soins de routine. Nous devons maintenant donner la priorité à la durée pendant laquelle la technologie de lecture pourrait permettre à nos scientifiques de mieux comprendre le génome et d'offrir de meilleurs résultats aux familles.