Baseclick GmbH a lancé une nouvelle méthode très efficace pour l'analyse des mutations SARS-CoV-2

La propagation rapide du nouveau variant B.1.1.7 du virus SRAS-CoV-2 en Grande-Bretagne et dans d'autres pays montre que des changements dans le génome du virus SRAS-CoV-2 peuvent conduire à de nouvelles propriétés biologiques. La plupart des quelque 12000 mutations dans le génome du virus SRAS-CoV-2 qui ont été identifiées jusqu'à présent depuis février 2020 n'ont pas changé les propriétés biologiques du virus. Cependant, certaines des près de 4 000 mutations qui ont été identifiées dans la protéine de pointe (S-Protein) ont influencé les propriétés biologiques d'infectivité, de progression de la maladie et d'immunogénicité du virus mutant SARS-CoV-2. Au printemps 2020, l'émergence de la mutation D614G dans la S-Protein a conduit à une augmentation de l'infectivité de cette nouvelle souche mutante SARS-CoV-2 et a presque entièrement remplacé la souche de Wuhan dans le monde. La mutation A222V dans la souche espagnole (20A.EU1), a conduit à nouveau à une augmentation de l'infectiosité et a commencé à remplacer la souche D614G en Europe à l'été 2020. La mutation N501Y-del69-70 en B.1.1.7 en Great La Grande-Bretagne, qui a été détectée pour la première fois en novembre 2020, a une fois de plus conduit à une augmentation de l'infectiosité. Depuis, les réinfections ont également augmenté avec l'apparition de ces nouvelles souches virales. Avec l'apparition de B.1.1.7, l'efficacité des vaccins a été remise en question et est actuellement à l'étude. Par conséquent, il est de plus en plus important de contenir et de gérer la progression de l'infection non seulement par la détection d'une infection par le SRAS-CoV-2, par exemple par PCR, mais également de réaliser une analyse génétique de la souche infectante. Actuellement, l'analyse génétique du SRAS-CoV-2 est basée sur les méthodes Amplicon. La partie du génome responsable de l'infectiosité, de la progression de la maladie et de l'immunogénicité est disséquée en petites sections et séquencée par la suite. Les mutations et donc d'éventuels nouveaux variants de virus sont déterminés à l'aide de méthodes mathématiques. En revanche, baseclick a mis au point un nouveau processus plus efficace pour déterminer non seulement les mutations prédominantes, mais également les mutations mineures survenant dans une population virale qui pourraient éventuellement devenir de nouvelles souches. Dr. Thomas Frischmuth, PDG de baseclick: "C'est une bonne nouvelle que baseclick a maintenant développé une méthode d'analyse très efficace pour analyser les mutations du SRAS-CoV-2 depuis l'apparition accrue de nouvelles souches de virus SARS-CoV-2. Avec notre kit de séquençage, le la section du génome responsable de l'infectiosité, de la progression de la maladie et de l'immunogénicité est directement analysée et les mutations peuvent être attribuées directement sans aucune étape mathématique intermédiaire. " Le "Click Tech Single Strain Mutation Mapping Kit for Sars-Co-V2" développé par baseclick GmbH, associé à des méthodes de séquence "longue lecture", par exemple fournies par Pacific Biosciences, permet une affectation génomique exacte et une évaluation de la fréquence des nouveaux émergents. variantes de virus dans la population. Avec la méthode d'analyse, il est également possible d'identifier toutes les mutations du SRAS-CoV-2 chez un patient COVID-19, y compris celles au cours de la maladie. Baseclick PDG Dr Thomas Frischmuth: «La recherche sur les mutations du SRAS-CoV-2 et les souches virales émergentes ne fait que commencer. Davantage de connaissances à ce sujet soutiendront le développement de vaccins, les thérapies et la gestion de cette pandémie, et nous faisons un nouveau et décisif contribution à cela. "