IDT abaisse les barrières génomiques avec le puissant système de séquençage rhAmpSeq ™

En tant qu'innovateur dédié aux outils et solutions pour les applications de la génomique, Integrated DNA Technologies (IDT) présente son système de séquençage unique rhAmpSeq ™, qui offre aux chercheurs un séquençage d'amplicon extrêmement précis, économique et facile à utiliser sur Illumina® next. plateformes de séquençage de génération (NGS). La chimie rhAmpSeq exclusive permet le multiplexage à des niveaux impressionnants avec des taux de cible élevés et une couverture uniforme, en fournissant des résultats précis et en accélérant les projets. Le système a de nombreuses applications, notamment la recherche sur les maladies humaines, le suivi et l'analyse des échantillons, l'analyse de l'édition du génome CRISPR et la biotechnologie agricole. Au cours des dernières années, le coût du séquençage NGS a considérablement diminué. Cependant, les coûts de préparation de la bibliothèque d'échantillons sont restés relativement statiques. Afin de défendre les intérêts des chercheurs en génomique en réduisant les barrières de coûts et en simplifiant les flux de travail, IDT a mis au point le système rhAmpSeq qui allie la puissance du NGS à la simplicité et à la valeur de la PCR. La nouvelle gamme de réactifs de séquençage ciblés rhAmpSeq constitue la deuxième plus grande offre de produits de génomique à exploiter la puissance de la technologie brevetée RNase H2 PCR (PCR) de la société IDT, après le populaire système de génotypage rhAmp ™ SNP de la société. Cette technologie utilise un système unique à deux enzymes RNase H2 / ADN polymérase couplé à des amorces hybrides ARN-ADN qui augmentent la spécificité de l'amplification PCR tout en minimisant la formation de dimères d'amorces – un véritable défi pour les autres chimies à base d'amplicon et la plus grande limitation du multiplexage par PCR . Le système rhAmpSeq permet des niveaux de multiplexage élevés – minimise le nombre de réactifs nécessaires et réduit les coûts grâce à sa capacité unique à minimiser la formation d’amorce-dimère et les produits de PCR mal amorcés. Un flux de travail simplifié et simple permet de gagner du temps en générant des bibliothèques d'amplicon prêtes pour NGS en seulement deux étapes simples de PCR. Le professeur Bruce Reisch du Collège d'agriculture et des sciences de la vie de l'Université Cornell dirige une collaboration de recherche multi-institutions qui a permis d'adapter la technologie rhAmpSeq à sa stratégie d'haplotype de 250 pb ciblant le génome central. «En tant que premiers testeurs du système rhAmpSeq d'IDT, nous avons été vraiment ravis de voir comment nous avons pu accélérer rapidement le programme VitisGen2 en utilisant un panel de près de 2 000 marqueurs rhAmpSeq pour analyser 19 groupes de liens Vitis. Le groupe de marqueurs de base était utile pour six populations non apparentées représentant la diversité du genre, et le flux de travail était très facile à utiliser et permettait un traitement à haut débit. »IDT a optimisé le système rhAmpSeq pour obtenir des performances constantes sur des tailles de panneaux allant de plusieurs dizaines à des milliers. amplicons dans une seule réaction multiplex et le système peut être utilisé avec un protocole standard ou à haut débit pour répondre aux besoins individuels. En outre, le système rhAmpSeq est extrêmement polyvalent – la technologie permet aux chercheurs de concevoir de grands panneaux personnalisés avec des tailles d'amplicons flexibles pouvant être adaptées à diverses applications et types d'échantillons. Trey Martin, président d'IDT, a ajouté: «Nous sommes vraiment ravis d'étendre notre portefeuille de produits NGS avec rhAmpSeq. Il existe un réel besoin d'un système de séquençage d'amplicon haute performance et nous sommes ravis de le commercialiser après plusieurs années de développement. La technologie PCR rhAmp d’IDT permet une plus grande spécificité dans les systèmes multiplex tout en simplifiant simultanément le flux de travail. Bien que notre objectif soit de fournir de meilleures données plus rapidement aux chercheurs, nous avons également conçu le système pour qu'il soit rentable. La mission et la longue tradition d’IDT sont de permettre aux chercheurs d’avoir un meilleur accès à des outils génomiques de haute qualité, abordables et qui donnent des résultats différenciés.