Die Baseclick GmbH hat eine neue und hocheffiziente Methode zur SARS-CoV-2-Mutationsanalyse eingeführt

Die rasche Ausbreitung der neu auftretenden SARS-CoV-2-Virusvariante B.1.1.7 in Großbritannien und anderen Ländern zeigt, dass Veränderungen im Genom des SARS-CoV-2-Virus zu neuen biologischen Eigenschaften führen können. Die meisten der seit Februar 2020 identifizierten rund 12.000 Mutationen im Genom des SARS-CoV-2-Virus haben die biologischen Eigenschaften des Virus nicht verändert. Einige der fast 4.000 Mutationen, die im Spike-Protein (S-Protein) identifiziert wurden, haben jedoch die biologischen Eigenschaften Infektiosität, Krankheitsprogression und Immunogenität des mutierten SARS-CoV-2-Virus beeinflusst. Im Frühjahr 2020 führte das Auftreten der D614G-Mutation im S-Protein zu einer Erhöhung der Infektiosität dieses neuen SARS-CoV-2-Mutantenstamms und hat den Wuhan-Stamm weltweit fast vollständig ersetzt. Die Mutation A222V im spanischen Stamm (20A.EU1) führte erneut zu einer Zunahme der Infektiosität und begann im Sommer 2020, den D614G-Stamm in Europa zu ersetzen. Die Mutation N501Y-del69-70 in B.1.1.7 in Great Großbritannien, das im November 2020 erstmals entdeckt wurde, führte erneut zu einer Zunahme der Infektiosität. Seitdem haben auch die Neuinfektionen mit dem Auftreten dieser neuen Virusstämme zugenommen. Mit dem Erscheinen von B.1.1.7 wurde die Wirksamkeit der Impfstoffe in Frage gestellt und wird derzeit untersucht. Daher wird es immer wichtiger, den Infektionsfortschritt nicht nur durch Nachweis einer SARS-CoV-2-Infektion, z. B. durch PCR, einzudämmen und zu steuern, sondern auch eine genetische Analyse des infizierenden Stammes durchzuführen. Derzeit basiert die genetische Analyse von SARS-CoV-2 auf den Amplicon-Methoden. Der Genomteil, der für Infektiosität, Krankheitsprogression und Immunogenität verantwortlich ist, wird in kleine Schnitte zerlegt und anschließend sequenziert. Mutationen und damit mögliche neue Virusvarianten werden mit mathematischen Methoden bestimmt. Im Gegensatz dazu hat baseclick ein neues und effizienteres Verfahren entwickelt, um nicht nur vorherrschende Mutationen, sondern auch geringfügig auftretende Mutationen in einer Viruspopulation zu bestimmen, die möglicherweise zu neuen Stämmen werden. Dr. Thomas Frischmuth, CEO von baseclick: "Es ist eine gute Nachricht, dass baseclick seit dem vermehrten Auftreten neuer SARS-CoV-2-Virusstämme eine hocheffiziente Analysemethode zur Analyse von SARS-CoV-2-Mutationen entwickelt hat Der Genomabschnitt, der für Infektiosität, Krankheitsprogression und Immunogenität verantwortlich ist, wird direkt analysiert und Mutationen können ohne mathematische Zwischenschritte direkt zugeordnet werden. " Das von der baseclick GmbH entwickelte "Click Tech Single Strain Mutation Mapping Kit für Sars-Co-V2" ermöglicht zusammen mit "Long-Read" -Sequenzmethoden, z. B. von Pacific Biosciences, eine genaue genomische Zuordnung und eine Bewertung der Häufigkeit neu auftretender Erkrankungen Virusvarianten in der Bevölkerung. Mit der Analysemethode ist es auch möglich, alle SARS-CoV-2-Mutationen innerhalb eines COVID-19-Patienten zu identifizieren, einschließlich derjenigen im Verlauf der Krankheit. Dr. Thomas Frischmuth, CEO von baseclick: "Die Erforschung der SARS-CoV-2-Mutationen und neu auftretenden Virusstämme steht erst am Anfang. Mehr Wissen darüber wird die Impfstoffentwicklung, Therapien und das Management dieser Pandemie unterstützen, und wir machen eine neue und entscheidende Beitrag dazu. "