OGT erweitert benutzerdefinierte NGS-Krebs-Panel-Inhalte und bereitet erweiterte Software für die Veröffentlic

Oxford Gene Technology (OGT), die Molecular Genetics Company, hat sein SureSeq myPanelâ € ™ NGS Custom Cancer Panel erweitert und deckt jetzt 120 vollständig optimierte Krebsgene ab. Der erweiterte Inhalt gibt den Forschern noch mehr Freiheit, ihre Sequenzierungsexperimente individuell anzupassen, wodurch sich die Konzentration auf Regionen von Interesse und das Einsparen von Zeit und Kosten ermöglicht. Neben proaktiven Aktualisierungen ist diese Erweiterung auch auf die Reaktionsfähigkeit von OGT auf Kundenanfragen zurückzuführen, für die das Unternehmen neue Inhalte erstellt, optimiert und validiert und in das Portfolio aufgenommen hat. OGTs Experten-kuratierte, solide Tumor- und Hämatologie-Panelinhalte ermöglichen es den Anwendern, nur die Gene und Regionen zu sequenzieren, die für ihre Krebsforschung relevant sind – den Durchsatz zu erhöhen und Sequenzierungsreagenzien einzusparen. Der streng voroptimierte Panel-Gehalt erleichtert die Entwicklung robuster NGS-Assays, ob diese mit anspruchsvollen Probentypen wie FFPE-Gewebe oder schwer zu sequenzierenden Genen arbeiten, entweder aufgrund ihres hohen GC-Gehalts oder der sich wiederholenden Bereiche des Genoms Natur, wie interne Tandemvervielfältigungen. Das einzigartige Panel-Design von OGT und die auf Hybridisierung basierende Zielanreicherung bieten eine beispiellose Gleichmäßigkeit der Abdeckung. Dies ermöglicht die konsistente und sichere Erkennung von Niedrigfrequenzvarianten bei gleichzeitiger Minimierung der Notwendigkeit eines ergänzenden Fill-in mit Sanger-Sequenzierung. Forscher können Inhalte aus einer breiten Palette verfügbarer NGS-Panel-Inhalte auswählen, die für solide Tumore verfügbar sind, die Brustkrebs, kolorektalen Krebs, Gliom, Lungenkrebs, Melanom, Eierstockkrebs, Prostatakrebs und Sarkom abdecken. Bei hämatologischen Malignomen umfasst der Panel-Inhalt die akute myeloische Leukämie (AML), die chronische lymphatische Leukämie (CLL), die chronische myeloische Leukämie (CML), das myeloproliferative Neoplasma (MPN), die myelodysplastischen Syndrome (MDS) und die myeloischen Malignitäten. Zusätzlich zu den erweiterten Inhalten hat OGT erfolgreiche Betatests der neuesten Version der SureSeq Interpret ™ Software abgeschlossen, einer NGS-Datenanalyse-Pipeline, die kostenlos mit SureSeq-Panels zur Verfügung gestellt wird. Mit dieser Software – dem NGO-Gegenstück von OGT – zielt die beliebte Microarray-Software von CytoSure Interpret auf die Unterstützung ihrer NGS-Panel-Anwender mit einer einfach zu bedienenden und verbesserten modularen Pipeline, Datenbank und Benutzerschnittstelle mit mehreren Einsatzoptionen, dynamischer Filterung und einer anpassbaren Berichtsstruktur einfache NGS-Datenverarbeitung und Interpretation. Dave Cook, Senior Product Manager bei OGT, kommentierte: "Unser stetig wachsender Custom-Panel-Content und die Entwicklung von NGS-spezifischer Software unterstreichen unser Engagement, den Kunden die leistungsstärksten und bequemsten NGS-Produkte auf dem Markt anzubieten. Es zeigt auch, wie reaktionsfreudig wir als Unternehmen sind und dass wir auf die Bedürfnisse unserer Kunden in Bezug auf die zusätzlichen Fähigkeiten unserer Datenanalysepipeline zur Begleitung unserer Panels gehört haben, die wir sehr bald liefern werden